Чаще всего зеленая игуана достигает половой зрелости только к 2 или 3 годам, в то время как насекомоядные игуаны созревают гораздо раньше ( примерно к 1 или 2 годам). Все игуаны яйцекладущие. Исследования, проведенные в 1972 г. Мюллером, показывают, что самки откладывают яйца 5-8 раз в течение жизни.

Спаривание происходит примерно за 3 – 7 недель до откладки яиц. Как и у большинства других тропических и субтропических ящериц, у зеленой игуаны нет четко определенного сезона спаривания и откладки яиц. Обычно этот сезон растягивается на 1 – 3 месяца. Какими бы ни были условия, самка откладывает яйца только один раз в сезон.

 Кладка яиц происходит в самый сухой сезон года, при наибольшем уровне солнечного облучения. В этом случае яйцам не грозит затопление; вылупление же, наоборот, приурочено к сезону дождей, когда много пищи.

Беременные самки игуаны выбирают для откладки яиц открытые места и роют нору с инкубационной камерой, достаточно вместительную, чтобы в ней было удобно развернуться. Во время строительства самцы охраняют территорию.

Кладка осуществляется в один прием и состоит из 14 – 76 продолговатых яиц длиной около 40 мм, одетых в кожистую  оболочку. Закончив кладку, самка лапами засыпает нору песком, оставляя камеру для воздуха. Во время инкубации, которая длится до 10 недель, температура в гнезде остается почти постоянной и равна 28 — 32?С. Развитие эмбриона протекает синхронно, и вылупление детенышей происходит одновременно. Новорожденные игуаны весят 1 г и достигают в среднем 75 мм. Они самостоятельно выбираются на поверхность.